Resumen de la tesis que presenta Elvira Zaret García Pérez como requisito parcial para la obtención
del grado de Maestra en Ciencias en Ciencias de la Vida
Análisis morfológico y molecular de aislados de Coolia Meunier (Dinophyceae) del Pacífico mexicano, Pacífico centroamericano y el Golfo de California, cultivados bajo condiciones semi-controladas
Resumen aprobado por:
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Dra. Lorena María Durán Riveroll
Directora de tesis
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Resumen en español
El género Coolia agrupa dinoflagelados bentónicos marinos ampliamente distribuidos en zonas tropicales y subtropicales, cuya identificación a nivel específico ha resultado un desafío debido a la similitud morfológica entre especies, la plasticidad fenotípica en cultivo y la compleja historia taxonómica del grupo. En este estudio se caracterizaron seis aislados recolectados en tres ecorregiones marinas de México: el Pacífico transicional, el Pacífico centroamericano y el Golfo de California. El objetivo fue identificarlas a nivel específico mediante la integración de enfoques taxonómico, morfométrico y molecular, además de documentar las dificultades metodológicas asociadas al estudio de cultivos bentónicos. La caracterización morfológica mediante microscopía de epifluorescencia y electrónica de barrido evidenció variabilidad en la dimensión dorsoventral, en la placa 7’’ y además permitió observar cambios en la morfología celular, desde formas redondeadas hasta estructuras irregulares o lobuladas, posiblemente vinculadas a la inducción de fases sexuales bajo condiciones de estrés ambiental. A nivel molecular, la región ITS presentó baja eficiencia de amplificación y productos divergentes, mientras que el marcador LSU (D1–D2) mostró un desempeño consistente y permitió recuperar secuencias de calidad en cinco de los seis aislados. Los análisis filogenéticos confirmaron la identidad de cinco aislados como Coolia malayensis y una como Coolia palmyrensis, lo que amplía el registro de distribución de esta última especie en México y revela además la existencia de variación genética de C. malayensis.
El género Coolia agrupa dinoflagelados bentónicos marinos ampliamente distribuidos en zonas tropicales y subtropicales, cuya identificación a nivel específico ha resultado un desafío debido a la similitud morfológica entre especies, la plasticidad fenotípica en cultivo y la compleja historia taxonómica del grupo. En este estudio se caracterizaron seis aislados recolectados en tres ecorregiones marinas de México: el Pacífico transicional, el Pacífico centroamericano y el Golfo de California. El objetivo fue identificarlas a nivel específico mediante la integración de enfoques taxonómico, morfométrico y molecular, además de documentar las dificultades metodológicas asociadas al estudio de cultivos bentónicos. La caracterización morfológica mediante microscopía de epifluorescencia y electrónica de barrido evidenció variabilidad en la dimensión dorsoventral, en la placa 7’’ y además permitió observar cambios en la morfología celular, desde formas redondeadas hasta estructuras irregulares o lobuladas, posiblemente vinculadas a la inducción de fases sexuales bajo condiciones de estrés ambiental. A nivel molecular, la región ITS presentó baja eficiencia de amplificación y productos divergentes, mientras que el marcador LSU (D1–D2) mostró un desempeño consistente y permitió recuperar secuencias de calidad en cinco de los seis aislados. Los análisis filogenéticos confirmaron la identidad de cinco aislados como Coolia malayensis y una como Coolia palmyrensis, lo que amplía el registro de distribución de esta última especie en México y revela además la existencia de variación genética de C. malayensis.
Palabras clave: diversidad, dinoflagelados, filogenia, morfometría, taxonomía
Resumen en inglés
The genus Coolia comprises marine benthic dinoflagellates widely distributed in tropical and subtropical regions. Species-level identification has proven challenging due to morphological similarity among species, phenotypic plasticity in culture, and the group’s complex taxonomic history. In this study, six isolates collected from three marine ecoregions of Mexico, the Mexican Transitional Pacific, the Central American, and the Gulf of California, were characterized. The aim was to achieve species-level identification by integrating taxonomic, morphometric, and molecular approaches, as well as to document the methodological difficulties associated with the study of benthic cultures. Morphological characterization through epifluorescence and scanning electron microscopy showed variability in dorsoventral dimension and in the 7’’ precingular plate and additionally allowed the observation of cellular morphology changes, rounded to irregular or lobulated shapes, possibly linked to the induction of sexual phases under environmental stress conditions. At the molecular level, the ITS region showed low amplification efficiency and divergent products, whereas the LSU (D1–D2) marker performed consistently and enabled the recovery of high-quality sequences in five of the six isolates. Phylogenetic analyses confirmed the identity of five isolates as Coolia malayensis and one as Coolia palmyrensis, expanding the distribution record of the latter species in Mexico and additionally revealing genetic variation within C. malayensis.
Palabras clave: diversity, dinoflagellates, morphometry, phylogeny, taxonomy