La domesticación del chile (Capsicum annuum) ha ocasionado cambios tanto en su fenotipo como en su diversidad genética, lo que ha modificado la forma en que interactúa con microorganismos benéficos. Estas alteraciones, derivadas de modificaciones en la estructura de las raíces, pueden disminuir los beneficios que las bacterias aportan en términos de crecimiento, reproducción y defensa. El objetivo de este estudio fue evaluar si la domesticación tiene un efecto sobre la colonización por la bacteria Pseudomonas sp. rbES061 en cuatro variedades domesticadas: Serrano, Jalapeño, Yahualica y Pimiento, y una planta silvestre de dos poblaciones en Sinaloa y Sonora. Se cuantificó la colonización endofítica por Pseudomonas sp. rbES061 en las plantas, se midió la Tasa Relativa de Crecimiento (TRC), la Concentración de Clorofila (ICC), la biomasa y la resistencia a las larvas de Spodoptera frugiperda. Los resultados mostraron un porcentaje de colonización de entre el 100% y el 77.7% para las variedades Jalapeño y Sinaloa, respectivamente. Los chiles domesticados Jalapeño, Yahualica y Serrano presentaron resultados significativos en los análisis de biomasa, ICC y supervivencia de S. frugiperda. Las larvas alimentadas con el chile silvestre Sinaloa inoculado con la cepa Pseudomonas sp. rbES061 presentaron mayor supervivencia. Posteriormente se llevó a cabo un experimento específico con tres variedades anteriormente usadas: Jalapeño, Serrano y Sinaloa. Siguiendo la misma metodología para biomasa, crecimiento y colonización. La variedad Sinaloa, presentó un aumento significativo de su altura y un peso de la raíz fresco al ser inoculado con la cepa Pseudomonas sp. rbES061. Mientras que las variedades domesticadas Jalapeño y Serrano presentaron los mayores niveles de colonización endofítica, con un 100% y 80%, respectivamente. De igual manera la colonización rizosférica fue de 88.8% en Jalapeño y 70% en Serrano. Estos resultados nos indican que en etapas tempranas de las plantas la cepa Pseudomonas sp. rbES061 tiene un mejor efecto en la variedad Sinaloa y en etapas tardías, como la maduración y el rendimiento, se tiene mejores resultados en la variedad Jalapeño. En conclusión, para evaluar adecuadamente los efectos de esta cepa, la etapa fenológica de las plantas resulta ser más determinante que su estado de domesticación.

The domestication of chili peppers (Capsicum annuum) has caused changes in both their phenotype and genetic diversity, which has altered the way they interact with beneficial microorganisms. These alterations, resulting from modifications in root structure, can reduce the benefits that bacteria provide in terms of growth, reproduction, and defense. The objective of this study was to evaluate whether domestication has an effect on colonization by the bacterium Pseudomonas sp. rbES061 in four domesticated varieties: Serrano, Jalapeño, Yahualica, and Pimiento, and a wild plant from two populations in Sinaloa and Sonora. Endophytic colonization by Pseudomonas sp. rbES061 in the plants was quantified, and the Relative Growth Rate (RGR), Chlorophyll Concentration (ICC), biomass, and resistance to Spodoptera frugiperda larvae were measured. The results showed a colonization percentage of between 100% and 77.7% for the Jalapeño and Sinaloa varieties, respectively. The domesticated Jalapeño, Yahualica, and Serrano peppers showed significant results in the analyses of biomass, ICC, and survival of S. frugiperda. Larvae fed with wild Sinaloa chili inoculated with the Pseudomonas sp. rbES061 strain showed higher survival rates. Subsequently, a specific experiment was carried out with three previously used varieties: Jalapeño, Serrano, and Sinaloa. The same methodology was followed for biomass, growth, and colonization. The Sinaloa variety showed a significant increase in height and fresh root weight when inoculated with the Pseudomonas sp. rbES061 strain. Meanwhile, the domesticated Jalapeño and Serrano varieties showed the highest levels of endophytic colonization, with 100% and 80%, respectively. Similarly, rhizosphere colonization was 88.8% in Jalapeño and 70% in Serrano. These results indicate that in the early stages of plant development, the Pseudomonas sp. rbES061 strain has a better effect on the Sinaloa variety, and in later stages, such as ripening and yield, better results are obtained in the Jalapeño variety. In conclusion, to adequately evaluate the effects of this strain, the phenological stage of the plants is more decisive than their domestication status.